آیین‌نامه‌ها، قوانین و معافیت‌های مالیاتی مرتبط با فعالیت بنیاد خیران و واقفان، به شرح زیر است:
اصلاحیه ضوابط اجرایی موضوع ماده ۱۷۲ (قانون مالیات‌های مستقیم)
ضوابط اجرایی موضوع ماده ۱۷۲ قانون مالیات‌های مستقیم اصلاحی ۱۳۹۴/۰۴/۳۱ به شرح ذیل اصلاح و ابلاغ می‌گردد.
۱- وجوهی که به حسابهای تعیین‌شده از طرف دولت به‌منظور بازسازی و یا کمک و نظائر آن به‌صورت بلاعوض پرداخت می‌شود، با تسلیم قبض بانکی به اداره امور مالیاتی ذی‌ربط از درآمد مشمول مالیات عملکرد سال پرداخت و از منبع مالیاتی که مؤدی انتخاب خواهد کرد کسر می‌گردد.
۲- صددرصد وجوهی که توسط مؤدیان مالیاتی به‌منظور مصرف در امور مشروحه زیر به حسابهای خاصی که در تهران از طرف وزارت یا سازمان ذی‌ربط و در استان‌ها از طرف ادارات کل یا سازمان‌های مربوط و در مورد دانشگاهها و مراکز آموزش عالی توسط روسای آن‌ها افتتاح می‌گردد واریز می‌شود، از درآمد مشمول مالیات عملکرد سال پرداخت و از منبع مالیاتی که مؤدی انتخاب خواهد کرد کسر خواهد شد. برداشت از حسابهای فوق با امضاء مشترک بالاترین مقام مسئول دستگاه و ذی‌حساب مربوط صورت می‌پذیرد و دستگاه دریافت‌کننده مکلف است صورت کمکهای دریافتی خود در هرسال را حداکثر تا آخر تیرماه سال بعد در تهران به سازمان امور مالیاتی کشور و در استان‌ها به اداره کل امور مالیاتی استان تسلیم نماید.
موارد مصرف وجوه واریزی یادشده عبارت‌اند از: تعمیر، تجهیز، احداث و یا تکمیل آن دسته از مدارس، دانشگاهها، مراکز آموزش عالی و مراکز بهداشتی و درمانی و یا اردوگاه‌های تربیتی و آسایشگاه‌ها، مراکز بهزیستی و کتابخانه‌ها و مراکز فرهنگی و هنری که بودجه آن‌ها به‌وسیله دولت تأمین می‌شود.
۳- وجوهی که جهت بهداشت و درمان و بهزیستی بیماران به انجمن حمایت از بیماران کلیوی، بنیاد امور بیماری‌های خاص، موسسه خیریه حمایت از کودکان مبتلا به سرطان، کانون بهبود و پرورش هموفیلیان ایران، انجمن امداد به بیماران سرطانی ایران (انجمن امداد ایران) و انجمن حمایت از بیماران سرطانی یزد که مورد تأیید وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی می‌باشند پرداخت می‌شود، مشروط به رعایت موارد ذیل از درآمد مشمول مالیات عملکرد سال پرداخت و از منبع مالیاتی منتخب مؤدی کسر می‌شود.
۴- کمکهای اعطائی غیر نقدی جهت انجام امور مذکور در بندهای ۲ و ۳ از درآمد مشمول مالیات عملکرد سال اعطاء کسر خواهد شد.
۵- درصورتی‌که اموال منقول یا غیرمنقول یا منافع اموال به‌عنوان کمک غیر نقدی به مؤسسات مذکور در بندهای ۲ و ۳ اعطاء گردد، ارزش اموال غیرمنقول اموال طبق نظر کارشناس رسمی دادگستری به تاریخ انتقال، تقویم و در مورد انتقال اموال منقول مبنای محاسبه قیمت روز اعطاء آن‌ها خواهد بود. و درصورتی‌که نسبت به مورد اخیر بین ادارات امور مالیاتی و اعطاء کنندگان راجع‌به میزان قیمت اختلاف بروز نماید، مرجع رسیدگی به اختلاف هیئت سه‌نفری حل اختلاف مالیاتی خواهد بود که رأی آن قطعی و لازم‌الاجرا بوده و در سایر مراجع مالیاتی قابل‌طرح نخواهد بود.
۶- ادارات امور مالیاتی با دریافت اصل قبوض بانکی پرداخت وجوه و یا اصل گواهینامه و یا اسناد تحویل کمکهای غیرنقدی و ضبط آن در پرونده مالیاتی (در مورد وجوه موضوع بند ۳ این ضابطه با کسب تأییدیه از مرجع ناظر ذی‌ربط) نسبت به کسر مبالغ پرداختی یا ارزش کمکهای غیر نقدی از درآمد مشمول مالیات عملکرد سال پرداخت یا اعطاء کمک از منبع منتخب مؤدی اقدام خواهند نمود.
۸- اصلاحات به‌عمل‌آمده در این ضوابط اجرایی از تاریخ ۱۳۹۹/۱/۱ لازم‌الاجرا می‌باشد.
فرهاد دژپسند، وزیر امور اقتصادی و دارایی
سعید نمکی وزیر بهداشت، درمان آموزش پزشکی
منصور غلامی وزیر علوم، تحقیقات و فن آوری
محسن حاجی میرزایی، وزیر آموزش و پرورش
