مسجد ثقلین دانشکده علوم قرآنی زاهدان با متراژ ۱۵۰۰ متر مربع و زیربنای کلی ۶۱۵ مترمربع در سال ۱۳۹۰ کلنگ زنی شده و هم اکنون با احداث اسکلت فلزی و گچ کاری محوطه اصلی داخلی مسجد و انجام سرامیک و سنگ کف مسجد که قریب به ۷۰% پروژه را در بر خواهد گرفت پیشرفت داشته است، متاسفانه به دلیل عدم برخورداری منابع مالی، ادامه پروژه متوقف گردیده است.
جهت اتمام این پروژه مذهبی به موارد ذیل نیاز می باشد:
| ردیف | شرح هزینه | مبلغ |
| ۱ | انجام راه پله | ۰۰۰/۰۰۰/۲۰۰ ریال |
| ۲ | اجرای سقف کاذب | ۰۰۰/۰۰۰/۶۰۰ ریال |
| ۳ | انجام محوطه سازی | ۰۰۰/۰۰۰/۰۰۰/۳ ریال |
| ۴ | ساخت ۲ عدد سرویس بهداشتی چهار چشمه و وضو خانه مجزا (خواهران و برادران) | ۰۰۰/۰۰۰/۰۰۰/۵ ریال |
| ۵ | دستمزد نما کار | ۰۰۰/۰۰۰/۰۰۰/۱ ریال |
| ۶ | ساخت درب و پنجره دو جداره | ۰۰۰/۰۰۰/۶۰۰ ریال |
| ۷ | لوازم الکتریکی و روشنایی | ۰۰۰/۰۰۰/۷۰۰ ریال |
| ۸ | خرید سنگ زیر نما | ۰۰۰/۰۰۰/۳۰۰ ریال |
| ۹ | دستگاه صوت و لوازم جانبی | ۰۰۰/۰۰۰/۰۰۰/۴ ریال |
| ۱۰ | اسپیلت سرد و گرم ۶۰ هزار | ۴۹۶/۰۰۰/۰۰۰ ریال |
| ۱۱ | اسپیلت سرد و گرم ۵۵ هزار | ۴۶۰/۰۰۰/۰۰۰ ریال |
| جمع کل : شانزده میلیارد و سیصد و پنجاه و شش میلیون ریال | ۰۰۰/۰۰۰/۳۵۶/۱۶ ریال | |
پیش‌بینی می‌شود با تأمین اعتبار مورد نیاز، طی یک ۶ ماه آینده، این مسجد به بهره‌برداری کامل برسد.
