دانشکده علوم قرآنی مشهد در سال ۱۳۸۰ تأسیس و در حال حاضر در دو مقطع کارشناسی و کارشناسی ارشد به تعلیم و تربیت دانشجو از میان داوطلبین کنکور سراسری در رشته های مختلف قرآنی با استفاده از اساتید مجرب می نماید.
تعداد فارغ التحصیلان این دانشکده که در مقاطع ارشد و دکتری سایر دانشگاه های معتبر کشور قبول شده و مشغول به تحصیل‌اند، نشان از موفقیت و سطح کیفی این مجموعه آموزشی است که بحمدلله با عنایت خداوند، قرآن و حضرت رضا (علیه السلام) محقق گردیده است.
اما آنچه این مجموعه و خادمان و دلدادگان به قرآن کریم را آزرده خاطر نموده، این است که مجموعه ای که طی بیست سال به‌نام دانشکده تربیت مدرس قرآن نامیده شده، مدرسه ای است با قدمت بالا و با مساحت تقریبی دو هزار مترمربع که عرصه و اعیان آن وقف بوده و هزینه زیادی بابت اجاره بهاء سالیانه پرداخت می گردد و نیز در میان تمامی دانشکده های کشور ضعیف ترین فضا را دارا است که نه تنها شایسته نام قرآن، بلکه شایسته شهر مقدس مشهد و پایتخت معنوی ایران نیز نیست به نحوی که علی رغم ظرفیت بالای شهر و نیز درخواست معتنابه قرآن پژوهان، محدود به یک رشته در مقطع کارشناسی و سه گرایش در مقطع ارشد و حدود ۵۰۰ دانشجو است و همچنین امکان تأسیس مقطع دکتری در آن نیست.
با عنایت به موارد فوق طی سال های ۸۲ تا ۸۹ با همت مسئولین شهر و استان به ویژه اداره کل اوقاف و امور خیریه خراسان رضوی زمینی در منطقه الهیه به مساحت ۴.۲ هکتار در سال ۸۹ از طرف سازمان مسکن و شهرسازی به این دانشکده واگذار شد.
متأسفانه به دلیل عدم تأمین اعتبار، ساخت آن سالیانی چند متوقف ماند. ولی در سال ۱۳۹۱ با پیگیری های مستمر و پشتیبانی و مساعدت شورای اسلامی شهر مشهد پروانه ساختمانی آن با متراژی قریب به ۲۸هزار متر مربع صادر گردید.
لازم به ذکر است در طراحی کلی این مجموعه از معماری اسلامی- ایرانی الهام گرفته شده است که با سطح اشغال ۸۰۰۰ متر مربع شامل دو مجموعه کلی؛ مجموعه اول شامل ساختمان آموزشی در مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری، سالن اجتماعات و قسمت های اداری و پژوهشی و مجموعه دوم شامل ساختمان های خدماتی، ورزشی، خوابگاه ها، استادسرا و … است که یک طبقه زیر زمین و سه طبقه روی زمین طراحی شده است.
در مرحله اول ساختمان آموزشی و سالن اجتماعات از اواخر شهریور ماه ۱۳۹۵ و با کلنگ زنی توسط نماینده وقت ولی فقیه و ریاست سازمان اوقاف و امور خیریه حجت الاسلام محمدی، نمایندگان مجلس شورای اسلامی و دیگر مسئولین استانی شروع به ساخت نمود.
هم اکنون ۹۸% از ابنیه ساختمان مذکور و به مساحت تقریبی ۵۵۰۰ متر مربع ساخته شده و نیز در بحث تأُسیسات مکانیکی قریب به ۶۰% و در بخش الکتریکال شیارزنی و لوله گذاری اتاق ها صورت پذیرفته است. و حدود ۸۰% گچ خاک مجموعه به اتمام رسیده است.
از تجهیزات مورد نیاز این پروژه دیگ چگالشی، چلیرها، دستگاه های اگزاست فن، هواسازها، فن کوئل ها، سیم و کابل، کاشی و سرامیک کف و بدنه، کناف و پنجره های آلومینومی مورد نیاز این مجموعه خریداری گردیده است.
پیش بینی می گردد با حداقل ۵ میلیارد تومان دیگر، فاز نخست این پروژه عمرانی، مورد بهره برداری و پذیرای دانشجویان و قرآن آموزان گرامی خواهد بود.